经过40余年的艰苦创业，长征医院现已成为学科齐全、技术配套、设备先进、环境舒适，集医疗、教学、科研为一体的综合性医院。医院设医教部、政治部、院务部、护理部四个职能部门，下设临床科室27个，医技科室9个，临床医学教研室17个，实验室25个，展开床位1052张。年门急诊量50余万，收治病人2万余，开展各类手术1.2万余例。近年来还参与并成功完成抗洪抢险、APEC会议、美国总统访华等医疗保障任务。
在学科建设上，始终描准学科发展前沿进行开拓性研究，形成了明显的技术优势和专业特色，先后建成了6个全军专科技术中心和研究所，并于2001年通过国家验收，进入国家重点学科行列；2个上海市医学领先专业学科。
骨科是全军骨科研究所，1995年跨入上海市医学领先专业重点学科，2001年成为国家重点学科。该科在脊柱外科、关节外科、创伤外科、修复功能重建等方面都具有国内先进水平，特别是颈椎伤病的诊治在国内外享有较高声誉，积累了10000余例手术治疗的经验。
神经外科是全军神经外科研究中心，上海市神经外科研究所，1996年跻身上海市医学领先专业重点学科。以急性颅脑外伤救治、颅内肿瘤及脑血管病的诊治见长，在国内享有很高声誉。其中，颅脑外伤的救治获军队医疗成果一等奖。该科在国内首先开展了脑胶质瘤基因治疗术，使我国成为继美国之后第二个开展此类技术的国家。
泌尿外科是全军泌尿外科中心。自1978年开始肾移植，至今已逾2300例，病人和移植肾的成活率分别达到97%和93%，成为国内开展肾移植数量最多、成功率最高的单位之一，曾获首届军队医疗成果一等奖，该科开展的泌尿系肿瘤手术治疗也居国内先进水平。
急救科全军急救医学中心，是国内最早开设急救专业的医院之一。在严重多发伤、多脏器衰竭的重症救治方面积累了丰富的经验，形成了自己的特色。急诊的“绿色通道”为危重急诊病人的救治提供了有力的保障，形成了重症伤病员“院前抢救-院内急救-重症监护”为一体的急救医疗体系。1999年被上海市卫生局确定为急诊ICU质量控制中心。
肾内科是全军肾脏病中心，是国内较早成立肾病专业组的医院之一。该科在急、慢性肾功能衰竭、肾小球疾病、小管间质疾病的诊治方面积累了丰富的经验，形成了自己的特色。特别是对多囊肾病分子发病机理及其干预措施的研究有独到之处，临床治疗水平较高。在国内率先研制开发成功的左旋肉碱注射液和口服液，用于治疗透析患者的肉碱缺乏症；对长期透析患者继发性甲旁亢的防治进行了系列研究，大大改善了患者的临床症状和预后。该科血液透析是目前国内规模最大、设备最先进、收治病人最多的血透中心之一。
实验诊断科是全军临床免疫中心，在肝病及肝纤维化形成机理和早期诊断等方面取得卓越成绩。对免疫球蛋白分子病的研究，处于国内领先水平，且赶上国际水平，先后发现罕见病例8例。
重点学科的建设成就，有效地带动和促进了一批具有专业特色的学科发展。皮肤科真菌病的治疗、心脏疾病的介入治疗、消化系统疾病的研究和防治、哮喘的综合治疗、肺癌的诊断和介入治疗、腹腔镜手术治疗、面部三叉神经病的治疗，整形美容、眼眶肿瘤、造血干细胞移植、肝移植、组织器官移植和再造、基因治疗等方面各展所长，形成了自己的医疗特色。另外上海市神经内科专家会诊中心，血液疑难病会诊中心、慢性肾病、肝病、肿瘤病理等各类专家会诊中心也设在该院。
医院拥有一支配置合理的人才队伍，其中高级专业技术人员200余名，享受政府特殊津贴人员54名，国家有突出贡献的中青年专家6名，有19人担任国家二级学术组织理事以上的职务。拥有17个博士点，30个硕士点，为临床医学博士后流动站，有博士生导师31名。 “九五”期间，医院共获各类科技成果奖80项。承担国家、军队、上海市等课题128项，连续5年在国家核心期刊发表科技论文数居全国各大医院的前11位。
医院拥有核磁共振成像仪、全身CT、数字减影仪、核素扫描仪、彩色多普勒超声仪等现代化医疗仪器，价值达2.5亿元人民币。拥有国际先进水平的全净化手术室20间，其中2间达到目前国际最高标准“百级”。大楼设有中央空调，楼顶可供直升机起降。
医院坐落在上海市黄浦区。东邻黄河路、南为南京路、北靠成都路、西依北京路，南北高架路从旁而过，交通便利。1997年医院建成的现代化病房大楼总建筑面积为61000平方米，设有1052张病床。既有4人间、3人间普通病房，也有2人间、1人间中档病房和具有星级标准的贵宾特需病房，能满足不同消费人群的需要。每个病房均拥有中心供氧、冷暖空调和24小时热水、淋浴。在为病人提供舒适、安全、和相对便捷的就医服务，医院严格执行国家收费标准，不增加病家负担，医疗收费处于上海市同类医院较低水平，真正作到以低廉的价格提供比较优质的服务。
医院大力倡导一切以病人为中心的人性化优质服务，在病人就诊的各个环节上采取了全方位便民措施。门诊设有网上和电话挂号预约服务，导医服务队为行动不便者提供帮助，医院设有病人检查护送队，接送病人检查治疗。医院还投入近千万元资金建成国内一流的医院信息系统，病人从门诊到住院的全部医疗和费用信息实行计算机管理，有效提高了医院工作效率和质量，也使病人排队、挂号、缴费、取药、等候检查的时间大为缩短。
